37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003905 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003905  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01619  hypothetical protein  90.64 
 
 		 203 aa  374  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1425  hypothetical protein  71.66 
 
 		 190 aa  257  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0990149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1908  hypothetical protein  63.74 
 
 		 200 aa  252  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  32.65 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  26.62 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  32.43 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  25.71 
 
 		 336 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  25.71 
 
 		 336 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  27.05 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  24.48 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  29.5 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  27.05 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  27.05 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  27.05 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  30.17 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  27.87 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  27.87 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  27.87 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  27.87 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  27.87 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  30 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  26.23 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  28.21 
 
 		 239 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  22.37 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  27.87 
 
 		 221 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  27.87 
 
 		 221 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  27.87 
 
 		 221 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  23.03 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  27.2 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  23.42 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  28.03 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1317  yecA family protein  26.24 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.223966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  22.07 
 
 		 232 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  22.07 
 
 		 232 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3553  yecA family protein  26.21 
 
 		 204 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  26.23 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>