14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1425 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1425  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0990149  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003905  hypothetical protein  71.66 
 
 		 203 aa  277  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01619  hypothetical protein  68.98 
 
 		 203 aa  268  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1908  hypothetical protein  60.77 
 
 		 200 aa  238  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  29.89 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  37.29 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  27.78 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  26.21 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  31.58 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  29.82 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  37.29 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3553  yecA family protein  29.25 
 
 		 204 aa  42  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  30.1 
 
 		 183 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  31.03 
 
 		 228 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>