25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01619 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01619  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003905  hypothetical protein  90.64 
 
 
203 aa  374  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1425  hypothetical protein  69.73 
 
 
190 aa  248  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0990149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1908  hypothetical protein  60.99 
 
 
200 aa  243  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  28.39 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  32.65 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  28.8 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  28.7 
 
 
183 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  27.75 
 
 
236 aa  48.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  28.8 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  23.21 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3553  yecA family protein  25.24 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0311519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  29.73 
 
 
235 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  26.53 
 
 
237 aa  44.7  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  24 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  22.37 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  26.5 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  24.22 
 
 
221 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  27.2 
 
 
223 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  21.53 
 
 
232 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  21.53 
 
 
232 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>