65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4194 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  100 
 
 		 221 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  33.33 
 
 		 267 aa  94.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  33.51 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  32.09 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  27.89 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  28.57 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  32.28 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  32.64 
 
 		 237 aa  84.7  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  30.43 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  30.43 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  30.43 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  30.43 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  30.43 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  30.43 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  30.05 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  26.98 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  31.22 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  33.33 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  28.21 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  31.11 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  31.25 
 
 		 259 aa  74.7  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  30.05 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  29.35 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  28.93 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  29.47 
 
 		 183 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  28.93 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  28.93 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  28.93 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  30.77 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  30 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  27.18 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  23.44 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  24.74 
 
 		 336 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  24.74 
 
 		 336 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  32.17 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  32.75 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  25.66 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  25.66 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  32.21 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0305  yecA family protein  31.9 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  27.81 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  26.11 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  32.26 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  31.01 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  32.17 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  28.51 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0863  YgfB and YecA  29.08 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3553  yecA family protein  28.65 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  27.62 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  27.62 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  27.07 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0788  yecA family protein  29.63 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  27.07 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01619  hypothetical protein  23.21 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1425  hypothetical protein  26.21 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0990149  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  28.18 
 
 		 195 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003905  hypothetical protein  23.42 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  26.63 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  26.63 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  25.61 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0521  IS66 family element, orf4  24.47 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0555  IS66 family orf4  24.47 
 
 		 201 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  26.95 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1643  hypothetical protein  29.28 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>