61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7393 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  100 
 
 		 336 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  100 
 
 		 336 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  34.29 
 
 		 210 aa  85.9  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  29.15 
 
 		 201 aa  85.9  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  29.29 
 
 		 198 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  30.7 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  32.59 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  30.11 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  31.13 
 
 		 226 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  30.81 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  30.27 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  27.4 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  25.96 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  27.4 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  25.96 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  25.96 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  25.96 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  25.96 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  25.96 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  25.96 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  25.96 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  25.48 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  25.95 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  25.95 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  25.95 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  25.95 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  25.95 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  28 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  23.08 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  25.79 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  25.79 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0227  hypothetical protein  45.78 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5523  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4637  hypothetical protein  45.59 
 
 		 89 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.501635 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4461  hypothetical protein  45.59 
 
 		 89 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  22.87 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4387  hypothetical protein  45.59 
 
 		 89 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  24.08 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3810  hypothetical protein  45.78 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3213  hypothetical protein  41.25 
 
 		 85 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2250  hypothetical protein  41.25 
 
 		 85 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4555  hypothetical protein  40.54 
 
 		 88 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  29.23 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  25.54 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  25.48 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7635  hypothetical protein  40.74 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  22.95 
 
 		 223 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  23.84 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  27.27 
 
 		 259 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0863  YgfB and YecA  32.58 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  28.45 
 
 		 239 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  28.57 
 
 		 235 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  29.06 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1425  hypothetical protein  44.64 
 
 		 87 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381649  hitchhiker  0.00229769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003905  hypothetical protein  25.71 
 
 		 203 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968515  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0695  hypothetical protein  36.49 
 
 		 110 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6414  hypothetical protein  33.8 
 
 		 90 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  24.55 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6882  hypothetical protein  35.21 
 
 		 86 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1902  hypothetical protein  42.42 
 
 		 65 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5406  yecA family protein  24.07 
 
 		 192 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>