21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1425 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1425  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  176  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381649  hitchhiker  0.00229769 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5912  hypothetical protein  55.42 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6882  hypothetical protein  51.81 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3810  hypothetical protein  48.78 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0227  hypothetical protein  48.78 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7635  hypothetical protein  46.15 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3213  hypothetical protein  42.67 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2250  hypothetical protein  42.67 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1902  hypothetical protein  50.82 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4387  hypothetical protein  38.27 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4637  hypothetical protein  38.27 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.501635 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4461  hypothetical protein  38.27 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6384  hypothetical protein  39.74 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6477  hypothetical protein  37.35 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  36.59 
 
 		 336 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  36.59 
 
 		 336 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2342  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 		 471 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6414  hypothetical protein  33.78 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0695  hypothetical protein  35.06 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4555  hypothetical protein  31.08 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5523  hypothetical protein  34.67 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.5369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>