16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0695 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0695  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  230  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4387  hypothetical protein  46.75 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4637  hypothetical protein  46.75 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.501635 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4461  hypothetical protein  46.75 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4555  hypothetical protein  39.47 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5523  hypothetical protein  35.14 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2342  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 		 471 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7635  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4491  hypothetical protein  40.98 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.714337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  36.49 
 
 		 336 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  36.49 
 
 		 336 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0227  hypothetical protein  32.91 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1902  hypothetical protein  36.84 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2250  hypothetical protein  34.85 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3213  hypothetical protein  34.85 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>