19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4637 on replicon NC_009999
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009661  Shew185_4387  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4637  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.501635 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4461  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4491  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.714337  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0695  hypothetical protein  46.75 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  45.59 
 
 
336 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  45.59 
 
 
336 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5523  hypothetical protein  47.69 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2250  hypothetical protein  38.75 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3213  hypothetical protein  38.75 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4555  hypothetical protein  40.28 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7635  hypothetical protein  38.37 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1425  hypothetical protein  48 
 
 
87 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381649  hitchhiker  0.00229769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3810  hypothetical protein  35.06 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0227  hypothetical protein  35.53 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6882  hypothetical protein  35.37 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5912  hypothetical protein  34.15 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6414  hypothetical protein  30.86 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6477  hypothetical protein  30 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>