14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4555 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4555  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  180  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5523  hypothetical protein  65.48 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0695  hypothetical protein  39.47 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  40.54 
 
 		 336 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  40.54 
 
 		 336 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4387  hypothetical protein  40.28 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4637  hypothetical protein  40.28 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.501635 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4461  hypothetical protein  40.28 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2250  hypothetical protein  37.8 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3213  hypothetical protein  37.8 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7635  hypothetical protein  37.84 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4491  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.714337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6477  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6414  hypothetical protein  36 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>