21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7635 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7635  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  173  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3213  hypothetical protein  84.71 
 
 
85 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2250  hypothetical protein  84.71 
 
 
85 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0227  hypothetical protein  58.82 
 
 
86 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3810  hypothetical protein  59.04 
 
 
86 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1902  hypothetical protein  55.38 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502981  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6882  hypothetical protein  42.68 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6477  hypothetical protein  45.33 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5912  hypothetical protein  41.46 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6414  hypothetical protein  42.67 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6384  hypothetical protein  42.67 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1425  hypothetical protein  46.15 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381649  hitchhiker  0.00229769 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  40.74 
 
 
336 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4461  hypothetical protein  38.37 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  40.74 
 
 
336 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4637  hypothetical protein  38.37 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.501635 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4387  hypothetical protein  38.37 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2342  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
471 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0695  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5523  hypothetical protein  44.93 
 
 
89 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4555  hypothetical protein  37.84 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>