20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3810 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3810  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  176  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0227  hypothetical protein  97.67 
 
 		 86 aa  169  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1902  hypothetical protein  86.15 
 
 		 65 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7635  hypothetical protein  59.04 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3213  hypothetical protein  53.57 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2250  hypothetical protein  53.57 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6477  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1425  hypothetical protein  48.78 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381649  hitchhiker  0.00229769 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6384  hypothetical protein  43.21 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6414  hypothetical protein  44.87 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5912  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6882  hypothetical protein  41.25 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.654907 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  45.78 
 
 		 336 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  45.78 
 
 		 336 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5523  hypothetical protein  44.62 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4461  hypothetical protein  35.06 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4637  hypothetical protein  35.06 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.501635 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4387  hypothetical protein  35.06 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2342  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 		 471 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0695  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>