More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3093 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  100 
 
 		 237 aa  494  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  34.8 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  33.62 
 
 		 432 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  31.14 
 
 		 237 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  40.13 
 
 		 201 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  32.6 
 
 		 221 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  32.6 
 
 		 221 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  32.17 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  32.17 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  32.3 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  32.16 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  32.16 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  32.16 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  32.16 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  32.16 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  32.17 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  32.17 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  32.17 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  32.16 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  32.2 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  31.6 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  31.6 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  32.19 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  31.12 
 
 		 198 aa  99.4  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  33.52 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  33 
 
 		 221 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  29.1 
 
 		 210 aa  89.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  29.69 
 
 		 198 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  28.5 
 
 		 226 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  34.26 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  29.22 
 
 		 235 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  31.56 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  28.45 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  30.91 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  27.57 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  22.22 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  27.39 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  27.4 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  27.4 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  25.87 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  28 
 
 		 214 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  26.59 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  25.38 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  27.39 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  26.69 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6093  yecA family protein  24.1 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1225  yecA family protein  24.1 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00521886  normal  0.0870592 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6363  yecA family protein  24.1 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5511  yecA family protein  24.1 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 836 aa  58.9  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 844 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  67.65 
 
 		 910 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 838 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5406  yecA family protein  31.03 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  91.3 
 
 		 864 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2745  yecA family protein  23.95 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  71.88 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 858 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  35.25 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 896 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  35.25 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  68.75 
 
 		 944 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  82.61 
 
 		 834 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  73.33 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  70.97 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  56.82 
 
 		 896 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  26.58 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  86.96 
 
 		 921 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  37.5 
 
 		 962 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  37.5 
 
 		 962 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  37.5 
 
 		 962 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  68.97 
 
 		 1200 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  25 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 848 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 897 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0305  yecA family protein  26.99 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 162 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  61.9 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  57.5 
 
 		 162 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3553  yecA family protein  32.8 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  24.36 
 
 		 183 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  60.61 
 
 		 1067 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 866 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 922 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  64.52 
 
 		 162 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 881 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 833 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 921 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 888 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  90.48 
 
 		 800 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 904 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 904 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 904 aa  52.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  60 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4329  yecA family protein  22.94 
 
 		 187 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  26.54 
 
 		 183 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  48.94 
 
 		 163 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  95 
 
 		 1277 aa  52.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  42.65 
 
 		 916 aa  52.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>