12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0788 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0788  yecA family protein  100 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  28.02 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  30.27 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  27.56 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  29.63 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  28.99 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3553  yecA family protein  30.28 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  27.4 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  26.87 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  25.91 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  26.25 
 
 		 221 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  27.07 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>