23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2010 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  431  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  36.09 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  34.62 
 
 		 274 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  34.02 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  36.45 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  32.67 
 
 		 281 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  34.62 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  34.62 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  31.36 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  30.69 
 
 		 314 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  29.15 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  28.5 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  24 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  28.18 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  24.67 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  31.91 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  31.91 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  25.66 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  26.8 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  31.58 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  26.8 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  29.03 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  26.74 
 
 		 432 aa  42  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>