30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0555 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0555  IS66 family orf4  100 
 
 
201 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0521  IS66 family element, orf4  99 
 
 
201 aa  410  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5406  yecA family protein  44.51 
 
 
192 aa  171  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4329  yecA family protein  29.68 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2745  yecA family protein  30.07 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  26.71 
 
 
225 aa  61.6  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  28.28 
 
 
232 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  28.28 
 
 
232 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1225  yecA family protein  29.32 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00521886  normal  0.0870592 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5511  yecA family protein  29.32 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6093  yecA family protein  29.32 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6363  yecA family protein  29.32 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  28.03 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  26.18 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  28.47 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  26.88 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  24.61 
 
 
237 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4361  hypothetical protein  27.54 
 
 
134 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0666994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  30.09 
 
 
239 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  28.12 
 
 
249 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  32.69 
 
 
228 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  29.01 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  25.44 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  25.97 
 
 
210 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  26.47 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  25.44 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  25.64 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0645  YecA family protein  30.19 
 
 
146 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663243  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  26.9 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  24.6 
 
 
221 aa  41.2  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>