More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1895 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  100 
 
 		 231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  28.63 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  28.63 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  28.26 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  31.76 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  29.92 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  29.48 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  29.75 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  29.75 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  31.03 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  30.17 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  31.17 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  28.63 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  28.63 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  29.75 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  29.75 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  29.75 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  29.75 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  29.75 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  30.28 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  25.42 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  28.63 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  26.22 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  28.21 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  28.21 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  28.21 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  28.3 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  25.43 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  28.21 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  25.61 
 
 		 432 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  24.89 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  52.27 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  82.14 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  28.23 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  27.2 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  64.86 
 
 		 910 aa  55.1  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 845 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 		 866 aa  55.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 916 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 836 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  54.35 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  70.97 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 838 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  25.58 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  72.41 
 
 		 135 aa  53.9  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  57.14 
 
 		 859 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 1200 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  62.86 
 
 		 1031 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  23.27 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  28.64 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  54.35 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  40.35 
 
 		 834 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  64.71 
 
 		 897 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 881 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 888 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 1067 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  47.73 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  86.36 
 
 		 309 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  43.4 
 
 		 848 aa  52  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  71.43 
 
 		 162 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 864 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 		 857 aa  52  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  85.71 
 
 		 909 aa  52  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 1136 aa  51.6  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  63.64 
 
 		 954 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 384 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  64.52 
 
 		 962 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  47.73 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 897 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 962 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 962 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 1024 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  90.48 
 
 		 421 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  81.82 
 
 		 420 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 900 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  59.46 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 855 aa  51.2  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 912 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 1004 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 921 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 896 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 1277 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  35.63 
 
 		 894 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 1029 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  65.52 
 
 		 933 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  65.71 
 
 		 937 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  90 
 
 		 168 aa  50.1  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 922 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 535 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  76 
 
 		 923 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 1017 aa  50.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  71.43 
 
 		 908 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 902 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 908 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 833 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 844 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 837 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 896 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 915 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 922 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>