More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1865 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  29.82 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  26.89 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  25.73 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  28.69 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  22.64 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  22.64 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  24.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  23.66 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  24.7 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  24.89 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  24.89 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  22.71 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  25 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  45.76 
 
 		 848 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  22.99 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  78.12 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  22.99 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  22.99 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  22.99 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  25.62 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  22.99 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  25.42 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  81.48 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  52.27 
 
 		 896 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  63.89 
 
 		 160 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  29.7 
 
 		 893 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  38.67 
 
 		 162 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  95.45 
 
 		 800 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 896 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  56.41 
 
 		 910 aa  56.2  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  91.3 
 
 		 384 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  57.5 
 
 		 838 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  45.28 
 
 		 907 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 888 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  82.61 
 
 		 535 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  95.24 
 
 		 866 aa  55.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 593 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  37.35 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 922 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  55 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  50.98 
 
 		 135 aa  53.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  70.97 
 
 		 923 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  72.41 
 
 		 161 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  45.61 
 
 		 897 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 844 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  47.17 
 
 		 907 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 958 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  85.19 
 
 		 160 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  23.83 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  64.86 
 
 		 164 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  23.83 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 858 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 916 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  23.83 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 864 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  23.83 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  23.83 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 909 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  23.83 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 894 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 957 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 837 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 836 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  43.4 
 
 		 907 aa  52.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 1136 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  23.44 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 863 aa  52.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  23.44 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  58.97 
 
 		 162 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 845 aa  52.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  84.62 
 
 		 165 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  67.74 
 
 		 834 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  81.82 
 
 		 909 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 881 aa  52  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 934 aa  52  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  63.89 
 
 		 164 aa  52  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 921 aa  52  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 912 aa  52  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  64.71 
 
 		 900 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  60 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  50 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 1031 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  31.63 
 
 		 909 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 1118 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 618 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 1200 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  35.63 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  26.61 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  46.67 
 
 		 872 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 421 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 1113 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  46.15 
 
 		 896 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 936 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  41.82 
 
 		 907 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 980 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 934 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>