More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0667 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 421 aa  881    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  25.24 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  27.89 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1588  SecC motif-containing protein  22.65 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000121054  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  56.82 
 
 		 922 aa  61.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  48 
 
 		 888 aa  60.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  65.79 
 
 		 980 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  45.16 
 
 		 866 aa  59.3  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  56.1 
 
 		 1136 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  42.59 
 
 		 910 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  63.64 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  58.33 
 
 		 848 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 837 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  82.61 
 
 		 921 aa  57  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 1200 aa  57  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  53.06 
 
 		 903 aa  56.6  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  42.86 
 
 		 899 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  62.5 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  62.5 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  62.5 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  62.5 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  62.5 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 881 aa  55.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 916 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  62.5 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 916 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 845 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 896 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  52.38 
 
 		 936 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 1031 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 897 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  36.78 
 
 		 921 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  80.77 
 
 		 992 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 836 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 904 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  49.02 
 
 		 917 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 894 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  75 
 
 		 909 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 912 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  34.48 
 
 		 922 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  44.9 
 
 		 907 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 910 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  52.5 
 
 		 896 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 864 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 837 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  36.84 
 
 		 914 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  36.84 
 
 		 914 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  55.88 
 
 		 958 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  47.92 
 
 		 933 aa  54.3  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 858 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 932 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 834 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 909 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 1113 aa  53.5  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  40.35 
 
 		 858 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  86.36 
 
 		 228 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 838 aa  53.9  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  53.49 
 
 		 901 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  70.37 
 
 		 1277 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  38.89 
 
 		 1004 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  52.5 
 
 		 907 aa  53.5  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 912 aa  53.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  47.06 
 
 		 1032 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  70.37 
 
 		 253 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  76 
 
 		 221 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  76 
 
 		 221 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  76 
 
 		 221 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  76 
 
 		 221 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  76 
 
 		 221 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  47.83 
 
 		 914 aa  53.1  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  76 
 
 		 221 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  45.45 
 
 		 844 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  76 
 
 		 221 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  76 
 
 		 221 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  76 
 
 		 221 aa  53.1  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  60.61 
 
 		 915 aa  53.1  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  47.83 
 
 		 914 aa  53.1  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 859 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0526  preprotein translocase subunit SecA  43.1 
 
 		 947 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723301  normal  0.383723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 939 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  61.76 
 
 		 963 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 800 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  40.82 
 
 		 907 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 842 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 930 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 931 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 896 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 896 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  81.82 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 931 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 931 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 931 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  85.71 
 
 		 875 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 930 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  78.26 
 
 		 166 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 936 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 930 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2518  preprotein translocase subunit SecA  48.94 
 
 		 903 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 931 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 931 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>