More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2565 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 161 aa  333  5e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  91.3 
 
 		 239 aa  311  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0373  hypothetical protein  65.14 
 
 		 202 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3024  hypothetical protein  45.45 
 
 		 210 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1588  SecC motif-containing protein  33.33 
 
 		 383 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000121054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  27.89 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  65.85 
 
 		 830 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  71.88 
 
 		 1136 aa  58.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 897 aa  57.4  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  40.79 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  49.06 
 
 		 834 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  45.1 
 
 		 858 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 864 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  65.62 
 
 		 909 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  33.72 
 
 		 894 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 838 aa  55.1  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  57.45 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 884 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  32.22 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  43.48 
 
 		 844 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 888 aa  54.3  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  38.82 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 896 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  69.7 
 
 		 902 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 837 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  35.37 
 
 		 535 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  63.33 
 
 		 881 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 		 921 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  95.24 
 
 		 875 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 917 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  95.24 
 
 		 866 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 		 921 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 859 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 1118 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 842 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  80.77 
 
 		 384 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  76 
 
 		 923 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  33.33 
 
 		 848 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 912 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  85.71 
 
 		 585 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  76 
 
 		 910 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 731 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  26.62 
 
 		 239 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 291 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  46.51 
 
 		 228 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  82.61 
 
 		 903 aa  51.6  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 800 aa  51.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 291 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 731 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  60 
 
 		 253 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 291 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  46 
 
 		 845 aa  51.2  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  90.48 
 
 		 378 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  48.84 
 
 		 900 aa  50.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1519  SecC motif-containing protein  54.29 
 
 		 488 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67332  normal  0.0279077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 909 aa  50.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  48.84 
 
 		 916 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  68 
 
 		 1200 aa  50.4  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  55.56 
 
 		 901 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  68.75 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 837 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 896 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 896 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 904 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 896 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  34.07 
 
 		 432 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  67.86 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  74.19 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 916 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  78.26 
 
 		 908 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  79.17 
 
 		 933 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  45.65 
 
 		 907 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  48.84 
 
 		 872 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  79.17 
 
 		 899 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21380  SEC-C motif-containing protein  25 
 
 		 665 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 916 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 910 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  62.86 
 
 		 419 aa  50.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 833 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 836 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  51.06 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  68.75 
 
 		 1067 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 907 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  36.71 
 
 		 944 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0831  hypothetical protein  78.26 
 
 		 869 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 907 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  61.29 
 
 		 319 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  38.55 
 
 		 309 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 939 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  48.15 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 907 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  55.81 
 
 		 618 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  70.83 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 915 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 903 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  54.76 
 
 		 593 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 908 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>