245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1519 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1519  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 488 aa  1018    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67332  normal  0.0279077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0335  hypothetical protein  34.25 
 
 		 544 aa  274  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.819744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0530  hypothetical protein  33.72 
 
 		 516 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0120  hypothetical protein  25.73 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0276  hypothetical protein  24.45 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 834 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  63.33 
 
 		 291 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  76 
 
 		 291 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  76 
 
 		 291 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  90.48 
 
 		 297 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  69.23 
 
 		 293 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  54.29 
 
 		 161 aa  50.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 897 aa  50.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  81.82 
 
 		 909 aa  50.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 1200 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  78.26 
 
 		 239 aa  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  68.97 
 
 		 866 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 912 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  70.83 
 
 		 1277 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 864 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 848 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 896 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  58.06 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  68.97 
 
 		 291 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 731 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 104 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 731 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 921 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 894 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 296 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  52.94 
 
 		 135 aa  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1114  SEC-C domain-containing protein  78.26 
 
 		 65 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326895 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  36.62 
 
 		 236 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 836 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 162 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 910 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 859 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 		 963 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 		 888 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  48.89 
 
 		 228 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  70.83 
 
 		 222 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  38.36 
 
 		 214 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1153  SecC motif-containing protein  78.26 
 
 		 65 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  29.92 
 
 		 276 aa  48.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  54.29 
 
 		 908 aa  48.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  29.92 
 
 		 276 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 1136 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 958 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  84.21 
 
 		 235 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  84.21 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3208  SEC-C motif domain protein  80 
 
 		 69 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176396  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 838 aa  47.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 286 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 858 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  84.21 
 
 		 319 aa  47.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 915 aa  47.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  66.67 
 
 		 283 aa  47.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  94.44 
 
 		 155 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  89.47 
 
 		 239 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  89.47 
 
 		 535 aa  47.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 957 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 844 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  45.61 
 
 		 170 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0292  metal-binding protein  80 
 
 		 332 aa  47  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 902 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  89.47 
 
 		 249 aa  47.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  35.38 
 
 		 855 aa  47  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  55.56 
 
 		 906 aa  47  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 922 aa  47  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4299  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 65 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 904 aa  47  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 837 aa  47  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 933 aa  46.6  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 881 aa  46.6  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 909 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 842 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3870  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 66 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.44355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2091  hypothetical protein  62.96 
 
 		 260 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  66.67 
 
 		 830 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  59.38 
 
 		 958 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  59.38 
 
 		 970 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 907 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  72.73 
 
 		 901 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  28.23 
 
 		 260 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  66.67 
 
 		 264 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1756  preprotein translocase, SecA subunit  59.38 
 
 		 970 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  89.47 
 
 		 253 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  30.16 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 910 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  69.57 
 
 		 921 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1138  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 67 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.556263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1416  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 63 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  59.38 
 
 		 958 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  78.95 
 
 		 228 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 859 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3738  preprotein translocase, SecA subunit  55.88 
 
 		 947 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361446  normal  0.764216 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 893 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  84.21 
 
 		 875 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  75 
 
 		 221 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  64 
 
 		 907 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>