More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1416 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1416  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 63 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1138  SecC motif-containing protein  82.09 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.556263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4299  SecC motif-containing protein  92.31 
 
 		 65 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1114  SEC-C domain-containing protein  89.23 
 
 		 65 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1153  SecC motif-containing protein  89.23 
 
 		 65 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3870  SecC motif-containing protein  72.73 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.44355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1216  SEC-C domain-containing protein  77.61 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50950  hypothetical protein  73.13 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400909  hitchhiker  0.0000141256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4346  hypothetical protein  77.97 
 
 		 58 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  77.78 
 
 		 291 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  77.78 
 
 		 291 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  76.67 
 
 		 293 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  77.78 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  45.45 
 
 		 925 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  62.16 
 
 		 1113 aa  55.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  74.19 
 
 		 899 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  73.33 
 
 		 1118 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  67.74 
 
 		 1102 aa  53.9  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  70.97 
 
 		 944 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  90.91 
 
 		 945 aa  53.5  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  70.97 
 
 		 962 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  72.41 
 
 		 1200 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 1067 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  70.97 
 
 		 962 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  70.97 
 
 		 962 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  72.41 
 
 		 916 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  69.7 
 
 		 896 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  76.92 
 
 		 296 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  72.41 
 
 		 916 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  62.07 
 
 		 992 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  90.48 
 
 		 920 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  52.63 
 
 		 902 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  57.89 
 
 		 931 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  95 
 
 		 314 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  68.97 
 
 		 834 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  65.52 
 
 		 954 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 864 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  57.89 
 
 		 931 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 		 838 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  64.71 
 
 		 906 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  59.38 
 
 		 1032 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 865 aa  50.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 909 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  76 
 
 		 916 aa  50.8  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 907 aa  50.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 919 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  66.67 
 
 		 249 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 936 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 904 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 904 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 904 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 897 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 858 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 896 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 896 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 924 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 917 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  62.07 
 
 		 907 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  60 
 
 		 384 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 1004 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 930 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  48 
 
 		 907 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 910 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 908 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 901 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 901 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  77.27 
 
 		 901 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 897 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 908 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 897 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 902 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 934 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 901 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 908 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 915 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 901 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 907 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 901 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 911 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 901 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 848 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 901 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 900 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  68.97 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 		 909 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 907 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 901 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 917 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 908 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 934 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 901 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 901 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 908 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 909 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 930 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 921 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 917 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 939 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 901 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>