More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1153 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1153  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 65 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1416  SecC motif-containing protein  89.23 
 
 		 63 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1114  SEC-C domain-containing protein  95.38 
 
 		 65 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4299  SecC motif-containing protein  96.92 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1138  SecC motif-containing protein  88.06 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.556263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3870  SecC motif-containing protein  74.24 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.44355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1216  SEC-C domain-containing protein  82.09 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4346  hypothetical protein  84.75 
 
 		 58 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50950  hypothetical protein  79.1 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400909  hitchhiker  0.0000141256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  81.48 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  81.48 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  81.48 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  73.33 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  77.42 
 
 		 899 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  76.67 
 
 		 1118 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  59.46 
 
 		 1113 aa  54.7  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  74.19 
 
 		 944 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 896 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  74.19 
 
 		 962 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  74.19 
 
 		 962 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  74.19 
 
 		 962 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  73.33 
 
 		 1067 aa  53.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  75.86 
 
 		 916 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 864 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  75.86 
 
 		 916 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 907 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  72.41 
 
 		 834 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  86.36 
 
 		 945 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 992 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  67.65 
 
 		 906 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 1102 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 919 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 904 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 907 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  68.97 
 
 		 1200 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  61.29 
 
 		 980 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  75.86 
 
 		 384 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 904 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 904 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  73.08 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  60.53 
 
 		 848 aa  50.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 936 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 910 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  41.27 
 
 		 925 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 1004 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 908 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  81.82 
 
 		 901 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 901 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 837 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 896 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  46.94 
 
 		 838 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  50 
 
 		 902 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 897 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  81.82 
 
 		 901 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  58.06 
 
 		 903 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 896 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 897 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 909 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  41.94 
 
 		 858 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 916 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  48.94 
 
 		 909 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 900 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 897 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 908 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 901 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 908 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 915 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 930 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 931 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 911 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 934 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 901 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 907 aa  50.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  95 
 
 		 260 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 917 aa  50.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 901 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 931 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 901 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 934 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 901 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 908 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 921 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 917 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 844 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 901 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 912 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  82.61 
 
 		 866 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  90 
 
 		 314 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 921 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  55.81 
 
 		 936 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 907 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  66.67 
 
 		 993 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 922 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  85.71 
 
 		 920 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>