More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3156 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  55.56 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  55.16 
 
 		 291 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  54.8 
 
 		 291 aa  285  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  45.49 
 
 		 296 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  25.18 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  44.83 
 
 		 992 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1416  SecC motif-containing protein  76.67 
 
 		 63 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 864 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4299  SecC motif-containing protein  76.67 
 
 		 65 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1216  SEC-C domain-containing protein  81.48 
 
 		 70 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4346  hypothetical protein  81.48 
 
 		 58 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  67.74 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  60.47 
 
 		 378 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1138  SecC motif-containing protein  76.67 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.556263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50950  hypothetical protein  81.48 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400909  hitchhiker  0.0000141256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0625  SecA, C-motif-containing protein  35.71 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0113543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1153  SecC motif-containing protein  73.33 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3870  SecC motif-containing protein  81.48 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.44355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 1200 aa  55.8  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1114  SEC-C domain-containing protein  73.33 
 
 		 65 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 837 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002976  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  79.17 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 837 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  63.41 
 
 		 881 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  60.61 
 
 		 834 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  90.48 
 
 		 1277 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  62.16 
 
 		 896 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  44.26 
 
 		 844 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  78.26 
 
 		 920 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  56.76 
 
 		 866 aa  53.5  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 958 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 848 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  74.07 
 
 		 384 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  58.54 
 
 		 858 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  78.26 
 
 		 945 aa  52.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  56.41 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  56.41 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  56.41 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  81.82 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  56.41 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  70.83 
 
 		 731 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  70.83 
 
 		 731 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 888 aa  52.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  56.41 
 
 		 221 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  67.65 
 
 		 833 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  40.79 
 
 		 1113 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  32.87 
 
 		 800 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 897 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0335  hypothetical protein  63.64 
 
 		 544 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.819744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  62.96 
 
 		 104 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  76 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  33.65 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1519  SecC motif-containing protein  69.23 
 
 		 488 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67332  normal  0.0279077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 836 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 865 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  66.67 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  68.75 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 872 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  78.26 
 
 		 916 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 838 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  68.97 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 896 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  46.67 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  89.47 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  70.97 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  40.58 
 
 		 921 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0943  SecC motif-containing protein  64.29 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368461  hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  53.66 
 
 		 899 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  73.91 
 
 		 421 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  62.07 
 
 		 875 aa  49.7  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  52.08 
 
 		 907 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  70.83 
 
 		 909 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  44.68 
 
 		 830 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 934 aa  49.7  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  64.71 
 
 		 166 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  89.47 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 		 907 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  89.47 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  89.47 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  89.47 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  89.47 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  89.47 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  63.33 
 
 		 236 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  89.47 
 
 		 221 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  47.27 
 
 		 859 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  89.47 
 
 		 221 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  89.47 
 
 		 221 aa  49.3  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  68.75 
 
 		 864 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  57.5 
 
 		 897 aa  48.9  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  57.14 
 
 		 585 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  39.68 
 
 		 906 aa  49.3  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  89.47 
 
 		 535 aa  49.3  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  47.92 
 
 		 907 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 1024 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  65.38 
 
 		 457 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  41.79 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  41.79 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>