221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1143 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 864 aa  1700    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  61.42 
 
 		 855 aa  957    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  26.42 
 
 		 457 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3272  SecC motif-containing protein  25.92 
 
 		 669 aa  71.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  30.61 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  30.15 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  54.76 
 
 		 928 aa  58.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  30.98 
 
 		 266 aa  57.4  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 936 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 899 aa  53.1  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2478  hypothetical protein  28.88 
 
 		 486 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648863  normal  0.064538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  25.37 
 
 		 288 aa  52.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 925 aa  52.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 920 aa  52.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  70 
 
 		 329 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  60.71 
 
 		 377 aa  51.6  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  72 
 
 		 900 aa  51.6  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  70 
 
 		 329 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  70 
 
 		 329 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  51.28 
 
 		 970 aa  51.6  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  46.67 
 
 		 294 aa  51.2  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2158  hypothetical protein  62.5 
 
 		 372 aa  51.2  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 1067 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  79.17 
 
 		 328 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  49.02 
 
 		 884 aa  50.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 911 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4517  SecC motif-containing protein  62.07 
 
 		 385 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 911 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 911 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3536  hypothetical protein  26.27 
 
 		 452 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2211  SecC motif-containing protein  64 
 
 		 375 aa  50.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 939 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 893 aa  49.3  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 992 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  68.75 
 
 		 293 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  56.76 
 
 		 921 aa  48.9  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  43.14 
 
 		 993 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1538  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 822 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 944 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  80.95 
 
 		 962 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 		 1118 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 921 aa  48.5  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 915 aa  48.5  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 932 aa  48.5  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 932 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 962 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 932 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 932 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 962 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  52.27 
 
 		 934 aa  48.1  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011814 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 916 aa  48.1  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 934 aa  47.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 913 aa  48.1  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 936 aa  47.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 931 aa  47.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 931 aa  47.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  76.19 
 
 		 923 aa  47.8  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 934 aa  47.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 934 aa  47.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 936 aa  47.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  33.71 
 
 		 291 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 1024 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 908 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  38.18 
 
 		 896 aa  47.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 163 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 904 aa  47.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3986  SEC-C motif domain protein  64.29 
 
 		 174 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 932 aa  47.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3880  hypothetical protein  72 
 
 		 135 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0869026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  38.14 
 
 		 235 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  52.63 
 
 		 921 aa  47.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 909 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 909 aa  47.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3479  methionine aminopeptidase, type I  68 
 
 		 291 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.234162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 906 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  84.21 
 
 		 909 aa  47.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  62.96 
 
 		 899 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 903 aa  47.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 907 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 931 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 931 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 858 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 930 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 914 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 910 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 908 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 908 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 844 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  76 
 
 		 236 aa  47  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 1004 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 908 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 907 aa  46.6  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2687  SEC-C motif domain protein  94.12 
 
 		 337 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.182718 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 931 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 907 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 908 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 909 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 939 aa  46.6  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  69.57 
 
 		 1010 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 908 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>