86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4517 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4517  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 385 aa  802    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2158  hypothetical protein  36.26 
 
 		 372 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2914  hypothetical protein  40.06 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2211  SecC motif-containing protein  34.25 
 
 		 375 aa  235  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  37.61 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2933  SecC motif-containing protein  31.49 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2062  hypothetical protein  31.16 
 
 		 378 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0964695  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2967  hypothetical protein  27.18 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1114  metal-binding protein  25.15 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2828  hypothetical protein  27 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00564462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0909  hypothetical protein  27.76 
 
 		 325 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2196  hypothetical protein  25.57 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  59.38 
 
 		 855 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  85 
 
 		 329 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  85 
 
 		 329 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  85 
 
 		 329 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  62.07 
 
 		 864 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  85 
 
 		 328 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 928 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  63.64 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0943  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368461  hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 920 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 970 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  56.76 
 
 		 288 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 925 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  28.95 
 
 		 294 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 909 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  55.26 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  62.07 
 
 		 908 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 911 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 911 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 911 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 939 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  29.73 
 
 		 289 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 934 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011814 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  29.73 
 
 		 289 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  83.33 
 
 		 993 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4023  SEC-C motif domain protein  84.21 
 
 		 133 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 917 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2761  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 906 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 992 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 899 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 930 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 897 aa  43.1  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3986  SEC-C motif domain protein  84.21 
 
 		 174 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 		 980 aa  43.1  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0831  hypothetical protein  66.67 
 
 		 869 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 924 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 908 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2831  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 908 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.125346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 904 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 899 aa  43.1  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10870  methionine aminopeptidase, type I  40.43 
 
 		 294 aa  43.1  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  unclonable  0.00000000208596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 904 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 904 aa  43.1  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 907 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 1118 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 911 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 900 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 908 aa  42.7  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 932 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 908 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 908 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 906 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 932 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 908 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 908 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 908 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 907 aa  42.7  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 910 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 908 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 932 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>