147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2158 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2158  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  761    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2914  hypothetical protein  51.75 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2211  SecC motif-containing protein  38.81 
 
 		 375 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  39.68 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4517  SecC motif-containing protein  36.26 
 
 		 385 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2062  hypothetical protein  31.86 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0964695  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2933  SecC motif-containing protein  31.36 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1114  metal-binding protein  28.78 
 
 		 393 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2828  hypothetical protein  29.08 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00564462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2967  hypothetical protein  28.66 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0909  hypothetical protein  27.3 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2196  hypothetical protein  27 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 		 992 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  62.5 
 
 		 864 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  69.57 
 
 		 855 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 970 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 925 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  38.81 
 
 		 1024 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 920 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 911 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 939 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 1010 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 911 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 911 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 928 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 913 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 913 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 186 aa  47.4  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 917 aa  46.6  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 1113 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  42.22 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  80 
 
 		 993 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  42.22 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  47.83 
 
 		 1277 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  83.33 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 924 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 930 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3561  SecC motif-containing protein  85 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  61.54 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1538  SEC-C motif domain protein  64 
 
 		 822 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3479  methionine aminopeptidase, type I  51.35 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.234162  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 		 980 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3439  methionine aminopeptidase, type I  76.19 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0407215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 917 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0468  SecC motif-containing protein  85 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10870  methionine aminopeptidase, type I  88.24 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  unclonable  0.00000000208596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0943  SecC motif-containing protein  85 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368461  hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  78.95 
 
 		 937 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 922 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  70 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  70 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 916 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  61.29 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 899 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 897 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 900 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 919 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  73.91 
 
 		 901 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 901 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 842 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 934 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  73.91 
 
 		 901 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 897 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  75 
 
 		 923 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 934 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 932 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  75 
 
 		 908 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 932 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  71.43 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  71.43 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 931 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  46.51 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 932 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 908 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  70.83 
 
 		 254 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 899 aa  44.3  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 936 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 904 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 910 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 904 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 904 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  52.78 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 932 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  73.91 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 931 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 904 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 936 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 907 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 917 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>