32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2914 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2914  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2158  hypothetical protein  51.75 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  43.06 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4517  SecC motif-containing protein  40.06 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2211  SecC motif-containing protein  34.33 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2933  SecC motif-containing protein  31.52 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2062  hypothetical protein  33.81 
 
 		 378 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0964695  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1114  metal-binding protein  32.65 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2828  hypothetical protein  26.52 
 
 		 347 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00564462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2967  hypothetical protein  29.9 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0909  hypothetical protein  26.06 
 
 		 325 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2196  hypothetical protein  24.65 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  69.23 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  58.82 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  58.82 
 
 		 329 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  58.82 
 
 		 329 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  47.17 
 
 		 855 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  54.55 
 
 		 294 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10870  methionine aminopeptidase, type I  70.83 
 
 		 294 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  unclonable  0.00000000208596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  55.56 
 
 		 864 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 920 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3439  methionine aminopeptidase, type I  53.57 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0407215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 928 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3479  methionine aminopeptidase, type I  80 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.234162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  65.38 
 
 		 288 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  53.57 
 
 		 289 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  36.67 
 
 		 1024 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  53.57 
 
 		 289 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 970 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 186 aa  43.1  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 909 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00180  methionine aminopeptidase, type I  66.67 
 
 		 290 aa  42.7  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.55421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>