12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1114 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1114  metal-binding protein  100 
 
 		 393 aa  814    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2914  hypothetical protein  32.65 
 
 		 379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2933  SecC motif-containing protein  29.06 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  29.08 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2158  hypothetical protein  28.78 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2211  SecC motif-containing protein  30.47 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2062  hypothetical protein  29.39 
 
 		 378 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0964695  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4517  SecC motif-containing protein  25.49 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2828  hypothetical protein  24.91 
 
 		 347 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00564462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2967  hypothetical protein  23.83 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0909  hypothetical protein  26.03 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2196  hypothetical protein  31.37 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>