25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2933 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2933  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 389 aa  815    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2062  hypothetical protein  34.4 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0964695  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  32.93 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4517  SecC motif-containing protein  31.49 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2914  hypothetical protein  31.52 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2158  hypothetical protein  31.36 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2211  SecC motif-containing protein  28.65 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1114  metal-binding protein  29.06 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2967  hypothetical protein  30.14 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2828  hypothetical protein  26.71 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00564462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2196  hypothetical protein  29.62 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0909  hypothetical protein  25.97 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 911 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 939 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  61.54 
 
 		 920 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  58.62 
 
 		 928 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 915 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 911 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 911 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  56.67 
 
 		 913 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  51.35 
 
 		 916 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  51.61 
 
 		 855 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  61.54 
 
 		 913 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  42.22 
 
 		 297 aa  42.7  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>