12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2062 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2062  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  780    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0964695  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2933  SecC motif-containing protein  34.4 
 
 
389 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394277  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2158  hypothetical protein  31.86 
 
 
372 aa  197  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  32.07 
 
 
377 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4517  SecC motif-containing protein  31.16 
 
 
385 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2914  hypothetical protein  33.81 
 
 
379 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2211  SecC motif-containing protein  30 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1114  metal-binding protein  29.39 
 
 
393 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2828  hypothetical protein  28.66 
 
 
347 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00564462  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2967  hypothetical protein  29.08 
 
 
456 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0909  hypothetical protein  25 
 
 
325 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2196  hypothetical protein  24.54 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>