More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0943 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0943  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 291 aa  605  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368461  hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  74.07 
 
 		 918 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  41.67 
 
 		 862 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 930 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 924 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  46.81 
 
 		 992 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  63.33 
 
 		 893 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  78.57 
 
 		 904 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  38.89 
 
 		 908 aa  56.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 915 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  57.89 
 
 		 1004 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 934 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 932 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  81.82 
 
 		 923 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 		 899 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 932 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 931 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 936 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 936 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 932 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 909 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 932 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 1118 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 931 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 934 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 932 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  68.75 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 910 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 936 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 934 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 1113 aa  54.7  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 1067 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 962 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 901 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 914 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 864 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  85.71 
 
 		 962 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 962 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 921 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 944 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 914 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 912 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 931 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  78.26 
 
 		 916 aa  53.9  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  60 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 931 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 931 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 931 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 931 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 900 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 930 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 931 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  61.11 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 921 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 931 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 896 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 896 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  37.31 
 
 		 862 aa  53.5  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  78.26 
 
 		 920 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 901 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 910 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  47.5 
 
 		 868 aa  53.1  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 901 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 901 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 900 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 901 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 901 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 930 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  78.26 
 
 		 945 aa  53.1  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  44.9 
 
 		 865 aa  53.5  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 921 aa  52.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 916 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 917 aa  53.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 917 aa  52.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  62.16 
 
 		 834 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  51.16 
 
 		 858 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 897 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  72 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  72 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  72 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 904 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 910 aa  52.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 904 aa  52.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 904 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  72 
 
 		 1024 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 907 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 908 aa  52.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 897 aa  52.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  59.52 
 
 		 922 aa  52.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 907 aa  52.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 909 aa  52.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 842 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 908 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 902 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>