58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2211 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2211  SecC motif-containing protein  100 
 
 
375 aa  785    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2158  hypothetical protein  38.81 
 
 
372 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2914  hypothetical protein  34.33 
 
 
379 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4517  SecC motif-containing protein  34.25 
 
 
385 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  35.14 
 
 
377 aa  222  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2933  SecC motif-containing protein  28.65 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2062  hypothetical protein  30 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0964695  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1114  metal-binding protein  30.47 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2828  hypothetical protein  25.4 
 
 
347 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00564462  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2967  hypothetical protein  25.94 
 
 
456 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0909  hypothetical protein  25.17 
 
 
325 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2196  hypothetical protein  25.26 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467319  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  78.26 
 
 
855 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  64 
 
 
864 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00180  methionine aminopeptidase, type I  52.08 
 
 
290 aa  50.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.55421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  69.23 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  69.23 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  54.29 
 
 
329 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  75 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  75 
 
 
294 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  68 
 
 
970 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  60.71 
 
 
992 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  68 
 
 
920 aa  46.6  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
186 aa  46.2  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10870  methionine aminopeptidase, type I  71.43 
 
 
294 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  unclonable  0.00000000208596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  30 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3880  hypothetical protein  58.33 
 
 
135 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0869026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
917 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  41.27 
 
 
284 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  59.38 
 
 
980 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  65.38 
 
 
993 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1538  SEC-C motif domain protein  73.91 
 
 
822 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3439  methionine aminopeptidase, type I  65.38 
 
 
289 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0407215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1153  SecC motif-containing protein  72.73 
 
 
65 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1114  SEC-C domain-containing protein  72.73 
 
 
65 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326895 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  65.38 
 
 
962 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 
962 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 
962 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  65.38 
 
 
289 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 
1024 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  65.38 
 
 
289 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 
928 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 
925 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4023  SEC-C motif domain protein  54.84 
 
 
133 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 
907 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 
932 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 
932 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 
922 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 
932 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 
932 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 
842 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  51.52 
 
 
297 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4346  hypothetical protein  68.18 
 
 
58 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 
934 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 
908 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 
911 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3986  SEC-C motif domain protein  55.17 
 
 
174 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0943  SecC motif-containing protein  53.12 
 
 
291 aa  42.7  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368461  hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>