266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3857 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 377 aa  788    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2914  hypothetical protein  43.06 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2158  hypothetical protein  39.68 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4517  SecC motif-containing protein  37.61 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2211  SecC motif-containing protein  35.14 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2933  SecC motif-containing protein  32.93 
 
 		 389 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2062  hypothetical protein  32.07 
 
 		 378 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0964695  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1114  metal-binding protein  29.08 
 
 		 393 aa  149  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2828  hypothetical protein  28.29 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00564462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2967  hypothetical protein  28.06 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0909  hypothetical protein  26.19 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2196  hypothetical protein  23.24 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 186 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  68.97 
 
 		 288 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 920 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 970 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  37.29 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  64.29 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  37.29 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  60.71 
 
 		 864 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  37.29 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 925 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  95 
 
 		 993 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 928 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  44.26 
 
 		 325 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  78.26 
 
 		 901 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  78.26 
 
 		 901 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  50.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  78.26 
 
 		 901 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 911 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 911 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 899 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 939 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 899 aa  48.9  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 911 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 		 992 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 900 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  73.91 
 
 		 855 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 910 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 897 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 842 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 934 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 931 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 896 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 904 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 932 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 917 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  90 
 
 		 962 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  80.95 
 
 		 908 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 907 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 1067 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 932 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 904 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 944 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 901 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 916 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 897 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 904 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 931 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 932 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0943  SecC motif-containing protein  56.76 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368461  hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 962 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 908 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 932 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 962 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 934 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 896 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 904 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 936 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  85 
 
 		 923 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 902 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 936 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 934 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 917 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 936 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 1118 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 980 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 922 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 910 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 907 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 908 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 932 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 908 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 919 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 930 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 907 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 917 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 917 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  33.66 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 908 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>