62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10624 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  100 
 
 		 855 aa  1660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  61.3 
 
 		 864 aa  962    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  25.84 
 
 		 457 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3272  SecC motif-containing protein  26.68 
 
 		 669 aa  67.8  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  31.61 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  32.12 
 
 		 284 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3536  hypothetical protein  26.47 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  27.22 
 
 		 288 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1402  hypothetical protein  26.11 
 
 		 454 aa  52.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  27.41 
 
 		 325 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2211  SecC motif-containing protein  78.26 
 
 		 375 aa  52  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2158  hypothetical protein  69.57 
 
 		 372 aa  51.6  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  31.49 
 
 		 266 aa  51.6  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4517  SecC motif-containing protein  57.58 
 
 		 385 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  32.5 
 
 		 903 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 928 aa  49.3  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  48.78 
 
 		 294 aa  49.3  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  73.91 
 
 		 377 aa  49.3  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  45.76 
 
 		 1024 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4637  hypothetical protein  24.43 
 
 		 483 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 920 aa  48.5  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3727  hypothetical protein  27.03 
 
 		 374 aa  48.5  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.754077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3479  methionine aminopeptidase, type I  89.47 
 
 		 291 aa  48.5  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.234162  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2914  hypothetical protein  47.17 
 
 		 379 aa  48.5  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2478  hypothetical protein  28.7 
 
 		 486 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648863  normal  0.064538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1538  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 822 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  53.33 
 
 		 970 aa  48.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 911 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 913 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 913 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 939 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 911 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 911 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  44.44 
 
 		 992 aa  47.8  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 899 aa  47.8  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 913 aa  47.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 916 aa  47.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00180  methionine aminopeptidase, type I  60.61 
 
 		 290 aa  47.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.55421 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10870  methionine aminopeptidase, type I  57.58 
 
 		 294 aa  47  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  unclonable  0.00000000208596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  54.29 
 
 		 297 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  70.37 
 
 		 328 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  84.21 
 
 		 329 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  84.21 
 
 		 329 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  62.96 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  48.72 
 
 		 903 aa  47  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  84.21 
 
 		 329 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  58.62 
 
 		 925 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  43.24 
 
 		 544 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 934 aa  45.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  64 
 
 		 900 aa  45.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  61.29 
 
 		 944 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  48.65 
 
 		 909 aa  45.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 907 aa  45.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  51.35 
 
 		 956 aa  44.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  61.54 
 
 		 291 aa  44.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  73.68 
 
 		 993 aa  44.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2777  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.1 
 
 		 372 aa  44.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000279721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 909 aa  44.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  52.78 
 
 		 239 aa  44.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  44.44 
 
 		 899 aa  44.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  64 
 
 		 291 aa  44.3  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  64 
 
 		 291 aa  44.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>