More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1602 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  84.81 
 
 		 284 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  48.51 
 
 		 288 aa  252  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  45.88 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1402  hypothetical protein  24.9 
 
 		 454 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  30.53 
 
 		 864 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  25.57 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  27.4 
 
 		 731 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  29.41 
 
 		 731 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3272  SecC motif-containing protein  28.96 
 
 		 669 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  53.85 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  74.29 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  70.97 
 
 		 585 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 932 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 932 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 932 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 932 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  82.61 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 834 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 864 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 921 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 836 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1029  hypothetical protein  26.78 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  30.73 
 
 		 855 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  84 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  84 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  84 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 844 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 924 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  95.24 
 
 		 910 aa  53.9  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 930 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 931 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 931 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 932 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 838 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 934 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 936 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 936 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 934 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 934 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 936 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 881 aa  53.1  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1973  SecC motif-containing protein  50 
 
 		 449 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  94.74 
 
 		 848 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3349  SEC-C motif domain protein  27.64 
 
 		 444 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  95 
 
 		 923 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 858 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  76 
 
 		 318 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 912 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  95 
 
 		 221 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  95 
 
 		 221 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 896 aa  52.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  95 
 
 		 221 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 837 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  95 
 
 		 221 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  94.74 
 
 		 909 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  95 
 
 		 221 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 922 aa  52.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3208  SEC-C motif domain protein  50 
 
 		 69 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  76 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 921 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  76 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  89.47 
 
 		 384 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 1136 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 921 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 888 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  94.44 
 
 		 845 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  94.74 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  94.74 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 1067 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 931 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  48.98 
 
 		 1277 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 944 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 931 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  94.74 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 904 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 931 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 931 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 912 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  61.76 
 
 		 875 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 930 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  90 
 
 		 962 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 904 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 914 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  94.74 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  94.74 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 909 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 904 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  85.71 
 
 		 918 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 931 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 914 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 962 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  94.74 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 962 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  94.74 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  94.74 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 904 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 931 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>