138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3349 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3349  SEC-C motif domain protein  100 
 
 
444 aa  902    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3210  SEC-C motif domain protein  96.17 
 
 
444 aa  815    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000775397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3214  SEC-C motif domain protein  42.76 
 
 
428 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3352  SEC-C motif domain protein  42.47 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3177  hypothetical protein  29.8 
 
 
422 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000125478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  43.64 
 
 
875 aa  50.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  27.64 
 
 
286 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 
857 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 
933 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 
1136 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 
845 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 
881 aa  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  77.27 
 
 
912 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
837 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  37.1 
 
 
266 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  72.73 
 
 
830 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  26.88 
 
 
731 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
1017 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  72.73 
 
 
901 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
922 aa  47  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  28.03 
 
 
731 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
932 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 
910 aa  47  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 
912 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2518  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 
903 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 
836 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 
930 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
896 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
921 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
840 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
845 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  72.73 
 
 
909 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
912 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 
910 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
894 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  35.59 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
836 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  35.71 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
855 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 
833 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
909 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
872 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1021  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
906 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 
905 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
888 aa  45.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
906 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 
859 aa  45.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
904 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  72.73 
 
 
903 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 
896 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 
949 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  68 
 
 
235 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  72.73 
 
 
112 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 
1022 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
917 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 
980 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
838 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 
957 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1871  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
906 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25156  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
869 aa  45.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 
897 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 
921 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3831  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 
905 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 
958 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1220  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 
916 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 
837 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 
848 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  64 
 
 
231 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 
1024 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 
864 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  53.57 
 
 
658 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  46.34 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
931 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  71.43 
 
 
421 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0512  preprotein translocase, SecA subunit  65.22 
 
 
931 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171651  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 
859 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 
858 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 
1031 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 
1024 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
931 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
931 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
932 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
930 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  69.57 
 
 
908 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
932 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 
898 aa  44.3  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1705  preprotein translocase subunit SecA  56 
 
 
849 aa  44.3  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
932 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
931 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
931 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
931 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
931 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2687  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
912 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.783539  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
932 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 
1027 aa  44.3  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  68.18 
 
 
914 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  72.73 
 
 
166 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 
866 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
912 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 
902 aa  43.9  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>