192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3214 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3214  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 428 aa  870    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3352  SEC-C motif domain protein  97.41 
 
 		 429 aa  789    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3210  SEC-C motif domain protein  44.82 
 
 		 444 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000775397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3349  SEC-C motif domain protein  44.57 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3177  hypothetical protein  28 
 
 		 422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000125478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  29.41 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  28.88 
 
 		 731 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 933 aa  51.6  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 857 aa  50.4  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 837 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 921 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  85.71 
 
 		 912 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 1136 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1220  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 916 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  45.61 
 
 		 875 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 912 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 911 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  76.19 
 
 		 830 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  80.95 
 
 		 901 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 881 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 917 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 910 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2518  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 903 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 836 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 896 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 845 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 912 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2687  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 912 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.783539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  39.56 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 922 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 910 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  80.95 
 
 		 909 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 894 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  69.23 
 
 		 235 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 840 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 845 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  27.64 
 
 		 286 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1021  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 906 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3831  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 905 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 859 aa  47  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 905 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 869 aa  47  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  80.95 
 
 		 903 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 1017 aa  46.6  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  41.07 
 
 		 378 aa  46.6  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 833 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 835 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 1031 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 906 aa  46.2  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 835 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 835 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 835 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 931 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 904 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 931 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 930 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 835 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 930 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 911 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 932 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 837 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 835 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 835 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 898 aa  46.2  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 872 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 855 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 859 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 931 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 931 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 835 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 931 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 931 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 931 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 909 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1871  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 906 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0512  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 931 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 835 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 868 aa  45.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 		 958 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 864 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 896 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 836 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  41.67 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 980 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 958 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 951 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 910 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 888 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 907 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1756  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 970 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 921 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 970 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0361  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 910 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.746169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  61.54 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 939 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7588  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 950 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.334261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 925 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 935 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0511  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 946 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>