More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3351 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  94.71 
 
 		 731 aa  1395    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 731 aa  1504    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1328  SEC-C motif domain protein  31.81 
 
 		 705 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000202726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  80.85 
 
 		 104 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1337  hypothetical protein  25.32 
 
 		 409 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3208  SEC-C motif domain protein  86.67 
 
 		 69 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  27.4 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3352  SEC-C motif domain protein  29.36 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  42.17 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  26.64 
 
 		 325 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3214  SEC-C motif domain protein  28.88 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  36.59 
 
 		 297 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  79.17 
 
 		 291 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  76 
 
 		 378 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 834 aa  54.7  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  28.48 
 
 		 284 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 888 aa  54.3  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 866 aa  54.3  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 291 aa  54.3  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 897 aa  53.9  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  22.84 
 
 		 288 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 864 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 896 aa  53.9  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 384 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  94.74 
 
 		 848 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 291 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 291 aa  53.5  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 858 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 910 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 836 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  70.83 
 
 		 293 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 838 aa  52.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 319 aa  52.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0292  metal-binding protein  65.52 
 
 		 332 aa  52.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  94.74 
 
 		 859 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 296 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  94.74 
 
 		 1136 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 921 aa  52  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  52  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 837 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  90 
 
 		 309 aa  52  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 239 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 844 aa  52  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 161 aa  51.6  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 535 aa  51.6  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  81.82 
 
 		 585 aa  51.6  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  94.74 
 
 		 228 aa  51.2  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 1200 aa  51.6  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  85 
 
 		 1277 aa  51.2  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 1031 aa  51.2  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  78.26 
 
 		 318 aa  51.2  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 922 aa  51.2  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 266 aa  50.8  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 958 aa  50.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 957 aa  50.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  94.74 
 
 		 830 aa  50.8  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 912 aa  50.8  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  94.44 
 
 		 845 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 896 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 800 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  100 
 
 		 283 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 894 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  94.74 
 
 		 253 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 618 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 872 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0468  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 334 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  84.21 
 
 		 909 aa  50.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 135 aa  50.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 257 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  89.47 
 
 		 593 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 276 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 276 aa  49.7  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 921 aa  50.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  89.47 
 
 		 160 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  94.44 
 
 		 899 aa  50.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  100 
 
 		 432 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 900 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 917 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  89.47 
 
 		 421 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  94.44 
 
 		 1067 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3561  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 334 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 162 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  73.08 
 
 		 335 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  76.19 
 
 		 221 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  80.95 
 
 		 249 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 881 aa  49.7  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1519  SecC motif-containing protein  80.95 
 
 		 488 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67332  normal  0.0279077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  88.89 
 
 		 908 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 907 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 904 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  94.74 
 
 		 170 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>