162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3208 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3208  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 69 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  86.67 
 
 		 731 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  86.67 
 
 		 731 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  86.67 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  50 
 
 		 286 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  38.1 
 
 		 457 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  48.84 
 
 		 297 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1328  SEC-C motif domain protein  58.93 
 
 		 705 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000202726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  70.83 
 
 		 291 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  70.83 
 
 		 378 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1519  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 488 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67332  normal  0.0279077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0292  metal-binding protein  73.91 
 
 		 332 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  72.73 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  72.73 
 
 		 585 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  76.19 
 
 		 319 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  80 
 
 		 309 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  62.5 
 
 		 293 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  72.73 
 
 		 296 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  72.73 
 
 		 318 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 864 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  33.82 
 
 		 335 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  89.47 
 
 		 384 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 834 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  84.21 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  50 
 
 		 284 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 888 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 866 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 896 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  76.19 
 
 		 535 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 897 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  64 
 
 		 235 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  88.89 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 858 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  84.21 
 
 		 253 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 848 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  78.95 
 
 		 228 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  65.22 
 
 		 266 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  84.21 
 
 		 800 aa  43.9  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  78.95 
 
 		 910 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 838 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  60.87 
 
 		 221 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  88.89 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  88.89 
 
 		 283 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  60.87 
 
 		 221 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  60.87 
 
 		 221 aa  43.5  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 859 aa  43.5  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  60.87 
 
 		 221 aa  43.5  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 836 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  78.95 
 
 		 921 aa  43.5  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  60.87 
 
 		 221 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 844 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  73.68 
 
 		 239 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 957 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  71.43 
 
 		 249 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  78.95 
 
 		 1200 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  88.89 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 1277 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  88.89 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  40.82 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 958 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  70 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 896 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 837 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0468  SecC motif-containing protein  53.12 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  76.19 
 
 		 257 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  77.78 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  66.67 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  75 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0032  hypothetical protein  50 
 
 		 469 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.555164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 1136 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  89.47 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  76.19 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  70 
 
 		 221 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 922 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  80.95 
 
 		 166 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  64 
 
 		 718 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  73.68 
 
 		 909 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  71.43 
 
 		 264 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 		 912 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 		 894 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  73.68 
 
 		 881 aa  41.6  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  89.47 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  60.87 
 
 		 231 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2091  hypothetical protein  63.64 
 
 		 260 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.68 
 
 		 289 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 278 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 872 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1588  SecC motif-containing protein  93.75 
 
 		 383 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000121054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  73.68 
 
 		 267 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  76.19 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 842 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>