18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0032 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0032  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  963    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.555164 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0020  hypothetical protein  25.94 
 
 		 460 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 855 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  77.78 
 
 		 859 aa  45.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  59.26 
 
 		 836 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 845 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 915 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  62.5 
 
 		 168 aa  44.7  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  87.5 
 
 		 909 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 912 aa  44.3  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 894 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 910 aa  43.9  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 858 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  48.48 
 
 		 897 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 1031 aa  43.9  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  64 
 
 		 585 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 896 aa  43.5  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 1017 aa  43.1  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>