More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1370 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  100 
 
 
135 aa  275  2e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  34.65 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 
859 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  36.05 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  40.43 
 
 
848 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  58.97 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  30.84 
 
 
896 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  55.26 
 
 
1200 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  69.44 
 
 
276 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  69.44 
 
 
276 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  77.42 
 
 
897 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  87.5 
 
 
866 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  95.45 
 
 
384 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  34.31 
 
 
864 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 
838 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  91.3 
 
 
228 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  47.27 
 
 
228 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  70.97 
 
 
267 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  70.97 
 
 
237 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  90.91 
 
 
800 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  73.33 
 
 
834 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  91.3 
 
 
888 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  33.8 
 
 
910 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  45.61 
 
 
836 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  30.84 
 
 
249 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 
896 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  38.3 
 
 
845 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  95.24 
 
 
535 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  91.67 
 
 
166 aa  53.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  50.98 
 
 
257 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  44.07 
 
 
844 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  90.91 
 
 
253 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  95 
 
 
585 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  72.41 
 
 
231 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  70 
 
 
291 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  95.45 
 
 
1136 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  70 
 
 
291 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 
858 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  43.55 
 
 
897 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  90.91 
 
 
378 aa  52.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 
901 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  90.91 
 
 
170 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 
844 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  56.76 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 
921 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  86.36 
 
 
235 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  68.57 
 
 
283 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  95.24 
 
 
618 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  82.61 
 
 
291 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  39.24 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 
833 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  80 
 
 
297 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  41.82 
 
 
944 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  51.85 
 
 
896 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  48.28 
 
 
896 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  90.91 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  81.82 
 
 
239 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  73.33 
 
 
1067 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  72.41 
 
 
901 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  82.61 
 
 
593 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 
872 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 
899 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  58.54 
 
 
980 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  59.52 
 
 
907 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 
421 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  30.91 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 
907 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  46.81 
 
 
912 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 
842 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 
910 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 
912 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  79.17 
 
 
909 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 
897 aa  50.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  85.71 
 
 
264 aa  50.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  55.56 
 
 
221 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  90 
 
 
1277 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 
908 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 
881 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 
911 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 
908 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  55.56 
 
 
221 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  55.56 
 
 
221 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  31.78 
 
 
916 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  55.56 
 
 
221 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  55.56 
 
 
221 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 
908 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  95 
 
 
259 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  60 
 
 
278 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 
908 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 
921 aa  50.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 
900 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  62.86 
 
 
272 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  95 
 
 
239 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 
922 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  37.14 
 
 
901 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  61.76 
 
 
281 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  90.48 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 
902 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  100 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>