More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1146 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 1277 aa  2614    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3344  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1233 aa  231  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0796  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1227 aa  225  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2894  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1272 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0926  hypothetical protein  24.75 
 
 		 695 aa  128  9e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.188543  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  76 
 
 		 384 aa  55.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 864 aa  55.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  76.92 
 
 		 297 aa  55.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  90.48 
 
 		 293 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  83.33 
 
 		 222 aa  54.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 		 1200 aa  54.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 848 aa  54.3  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 896 aa  54.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 897 aa  54.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 866 aa  54.3  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  76 
 
 		 962 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 910 aa  53.5  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  76 
 
 		 962 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  77.78 
 
 		 535 aa  53.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 156 aa  53.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  76 
 
 		 962 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 888 aa  53.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 838 aa  53.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 836 aa  53.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  70.37 
 
 		 421 aa  53.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  95 
 
 		 170 aa  53.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  56.41 
 
 		 378 aa  53.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 291 aa  53.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  90.48 
 
 		 221 aa  52.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  90.48 
 
 		 221 aa  52.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 844 aa  52.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  90.48 
 
 		 221 aa  52.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 162 aa  52.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  90 
 
 		 166 aa  52.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 921 aa  52.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 834 aa  52.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  90.48 
 
 		 221 aa  52.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  90.48 
 
 		 221 aa  52.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 1113 aa  52.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 160 aa  52.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  64.29 
 
 		 228 aa  52.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  95 
 
 		 253 aa  52.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 896 aa  52.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 291 aa  52.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 296 aa  52.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  95 
 
 		 267 aa  52.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1973  SecC motif-containing protein  40.54 
 
 		 449 aa  52  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  95 
 
 		 237 aa  52  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  90 
 
 		 168 aa  52  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 291 aa  52  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 291 aa  52  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  90 
 
 		 168 aa  52  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  90 
 
 		 228 aa  51.6  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  45.28 
 
 		 104 aa  52  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  90.48 
 
 		 249 aa  52  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  90 
 
 		 168 aa  52  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 912 aa  52  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  90 
 
 		 168 aa  52  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 922 aa  51.6  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 837 aa  51.6  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  72 
 
 		 881 aa  51.6  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 1136 aa  51.6  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  85 
 
 		 909 aa  51.6  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 859 aa  51.6  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  69.23 
 
 		 800 aa  51.6  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 858 aa  51.6  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  90 
 
 		 152 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 152 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  81.82 
 
 		 585 aa  51.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 872 aa  51.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 731 aa  51.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  90 
 
 		 159 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 731 aa  51.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  90 
 
 		 152 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 162 aa  51.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  94.74 
 
 		 168 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  90 
 
 		 159 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  74.07 
 
 		 920 aa  51.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  73.08 
 
 		 945 aa  50.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 894 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  77.27 
 
 		 155 aa  51.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  90 
 
 		 152 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  90 
 
 		 152 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 135 aa  51.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  90 
 
 		 152 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  90 
 
 		 152 aa  51.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  85.71 
 
 		 221 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  94.74 
 
 		 309 aa  50.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  48.98 
 
 		 286 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  72 
 
 		 944 aa  50.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  85.71 
 
 		 231 aa  50.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 924 aa  50.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 239 aa  50.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  66.67 
 
 		 235 aa  50.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  85.71 
 
 		 221 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  85.71 
 
 		 160 aa  50.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  85 
 
 		 908 aa  50.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 930 aa  50.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 908 aa  50.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  85 
 
 		 162 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>