201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0418 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 335 aa  689    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2253  hypothetical protein  44.54 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2405  hypothetical protein  44.24 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1472  hypothetical protein  42.25 
 
 		 339 aa  266  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0409  hypothetical protein  37.66 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.550319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2235  hypothetical protein  44.94 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.271057  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3561  SecC motif-containing protein  29.75 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0292  metal-binding protein  28.32 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0468  SecC motif-containing protein  28.57 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2645  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  95 
 
 		 830 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  90.48 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 833 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  73.08 
 
 		 731 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  73.08 
 
 		 731 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0739  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 96 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 896 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 896 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  70.37 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 910 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  66.67 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 872 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  70.37 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 888 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  73.08 
 
 		 104 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  76.19 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  72 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 866 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 844 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 864 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 848 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 897 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  50 
 
 		 1277 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 800 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 838 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 834 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  56.25 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 618 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.93 
 
 		 875 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 535 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 910 aa  46.6  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0335  hypothetical protein  54.55 
 
 		 544 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.819744  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 858 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 135 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 836 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 857 aa  46.2  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 1136 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  77.27 
 
 		 253 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  85 
 
 		 228 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 921 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3214  SEC-C motif domain protein  41.67 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 1017 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  85.71 
 
 		 166 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 162 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  85 
 
 		 718 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 840 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 845 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  71.43 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  71.43 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3208  SEC-C motif domain protein  33.82 
 
 		 69 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 859 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  72.73 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  72.73 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  85 
 
 		 585 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 922 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 835 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 835 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 835 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 835 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 912 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  73.91 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  73.91 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 835 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  66.67 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 160 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  80 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  84.21 
 
 		 912 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 835 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  75 
 
 		 909 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 835 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 835 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1538  SEC-C motif domain protein  78.26 
 
 		 822 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  75 
 
 		 901 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 912 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 881 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  85 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 837 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  61.54 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 1200 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 836 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.58 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 835 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 958 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 239 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>