63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4625 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  100 
 
 
464 aa  927    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.39 
 
 
467 aa  223  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.09 
 
 
482 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.09 
 
 
482 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.09 
 
 
482 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.09 
 
 
482 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4604  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  49.5 
 
 
220 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5199  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.73 
 
 
471 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.34 
 
 
442 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.18 
 
 
472 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.52 
 
 
476 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.51 
 
 
390 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.75 
 
 
205 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  33.02 
 
 
224 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  33.02 
 
 
219 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  33.02 
 
 
219 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  33.02 
 
 
219 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  33.02 
 
 
219 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  33.02 
 
 
219 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.42 
 
 
205 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  31.91 
 
 
188 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.6 
 
 
192 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  31.22 
 
 
189 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  32.41 
 
 
205 aa  99.8  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.08 
 
 
561 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.19 
 
 
197 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  31.28 
 
 
198 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  31.79 
 
 
198 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.99 
 
 
198 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.28 
 
 
233 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.66 
 
 
205 aa  91.3  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31 
 
 
236 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.5 
 
 
236 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.55 
 
 
181 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  27.27 
 
 
200 aa  88.2  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.07 
 
 
181 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.3 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  31.79 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  31.79 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  28.38 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4882  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.16 
 
 
207 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.32 
 
 
200 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  30 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.8 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  29.06 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.64 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  30.32 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3173  hypothetical protein  34.83 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.32 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.43 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.76 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.78 
 
 
521 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  30.49 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3019  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.05 
 
 
230 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  27.91 
 
 
180 aa  65.1  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.67 
 
 
522 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.45 
 
 
189 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3905  hypothetical protein  26.32 
 
 
453 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  31.13 
 
 
280 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2253  hypothetical protein  32.5 
 
 
339 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2405  hypothetical protein  32.43 
 
 
339 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  34.58 
 
 
335 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0803  hypothetical protein  58.82 
 
 
61 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>