69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2027 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  100 
 
 		 522 aa  1077    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  49.53 
 
 		 521 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1119  hypothetical protein  34.52 
 
 		 362 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.408559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1543  hypothetical protein  34.33 
 
 		 357 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0240179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  44.59 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2260  hypothetical protein  28.76 
 
 		 337 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  43.57 
 
 		 390 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  37.09 
 
 		 188 aa  107  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  43.06 
 
 		 236 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  43.06 
 
 		 236 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  39.29 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.71 
 
 		 233 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.36 
 
 		 181 aa  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  38.73 
 
 		 189 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.36 
 
 		 181 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.01 
 
 		 189 aa  90.5  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0102  hypothetical protein  23.25 
 
 		 336 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.602407  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.86 
 
 		 482 aa  87.8  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.86 
 
 		 482 aa  87.8  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.86 
 
 		 482 aa  87.8  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.86 
 
 		 482 aa  87.8  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.29 
 
 		 472 aa  87  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  38.69 
 
 		 198 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  35.95 
 
 		 180 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.76 
 
 		 197 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.97 
 
 		 198 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.17 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.42 
 
 		 205 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  37.96 
 
 		 205 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.42 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.78 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.8 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.39 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  32.37 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.21 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  32.24 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.24 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.9 
 
 		 211 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.24 
 
 		 200 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  34.67 
 
 		 198 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  31.28 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.29 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  37.41 
 
 		 200 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  37.41 
 
 		 200 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5199  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.28 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4882  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.98 
 
 		 207 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.33 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77483  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  32.14 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.09 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  27.86 
 
 		 200 aa  66.6  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.67 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.95 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3019  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25.73 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4604  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.65 
 
 		 220 aa  54.3  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3173  hypothetical protein  37.35 
 
 		 237 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  28 
 
 		 212 aa  51.2  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2506  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.64 
 
 		 130 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0566  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25.41 
 
 		 130 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1853  hypothetical protein  24.09 
 
 		 169 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4150  hypothetical protein  32.04 
 
 		 221 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0603  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4772  hypothetical protein  28.21 
 
 		 645 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021908 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5922  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.38 
 
 		 114 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5295  hypothetical protein  36 
 
 		 164 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>