39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0803 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0803  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  58.62 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  58.62 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  58.62 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  63.64 
 
 
198 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  43.1 
 
 
197 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  46.55 
 
 
205 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4150  hypothetical protein  55.32 
 
 
221 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  49.06 
 
 
200 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  49.06 
 
 
200 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  52.46 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  44.83 
 
 
198 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  46.55 
 
 
205 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.6 
 
 
390 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  41.38 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  41.38 
 
 
561 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  45.61 
 
 
211 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  46.55 
 
 
200 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  45.61 
 
 
205 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  47.17 
 
 
224 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  47.17 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  47.17 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  47.17 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  47.17 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  47.17 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  42.11 
 
 
205 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.84 
 
 
383 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  43.14 
 
 
188 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  45.28 
 
 
181 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40 
 
 
467 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  37.29 
 
 
212 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  52.38 
 
 
189 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3019  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  48.72 
 
 
230 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  33.93 
 
 
189 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  58.82 
 
 
464 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  43.4 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.21 
 
 
231 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  42.86 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>