70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4396 on replicon NC_009433
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  100 
 
 		 200 aa  406  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  406  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  96 
 
 		 200 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4150  hypothetical protein  78.74 
 
 		 221 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  55.67 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  47.69 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  47.69 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  47.83 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  42.31 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  44.62 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  44.17 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  43.56 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  38.67 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  40.85 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  36.96 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  38.67 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  38.67 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  38.67 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  38.67 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  38.67 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  40.59 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  43.6 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.39 
 
 		 390 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.6 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.56 
 
 		 181 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.78 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.95 
 
 		 467 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  36.42 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.95 
 
 		 236 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.95 
 
 		 236 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.79 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  38.67 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.99 
 
 		 561 aa  104  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.74 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  33.72 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4882  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.21 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  35.47 
 
 		 432 aa  99.4  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.39 
 
 		 233 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.6 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.44 
 
 		 482 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.44 
 
 		 482 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.44 
 
 		 482 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.44 
 
 		 482 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.67 
 
 		 383 aa  88.6  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3173  hypothetical protein  37.5 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5199  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.89 
 
 		 471 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  35.03 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.45 
 
 		 442 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.32 
 
 		 464 aa  78.2  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.04 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.24 
 
 		 522 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4604  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.39 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.24 
 
 		 472 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0803  hypothetical protein  58.62 
 
 		 61 aa  75.5  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  32.39 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  33.88 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25.97 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3019  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.98 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4159  hypothetical protein  72.09 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.75 
 
 		 476 aa  65.1  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77483  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00805  hypothetical protein  29.03 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1536  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.17 
 
 		 512 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1853  hypothetical protein  24.82 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5922  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.33 
 
 		 114 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0566  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.2 
 
 		 130 aa  51.2  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2506  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.4 
 
 		 130 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4922  hypothetical protein  25.93 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1254  hypothetical protein  25.31 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0853  hypothetical protein  24.63 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0265193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>