68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1350 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  74.6 
 
 		 189 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.78 
 
 		 390 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  41.81 
 
 		 561 aa  144  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.72 
 
 		 181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.63 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.21 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.16 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.08 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.29 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.42 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4882  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.15 
 
 		 207 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  35.47 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.18 
 
 		 467 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  34.44 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.83 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.83 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.3 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  32.22 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.77 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.84 
 
 		 383 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.09 
 
 		 522 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  34.92 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  34.92 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  34.92 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  34.92 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  34.92 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  34.92 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  33.14 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.91 
 
 		 464 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.72 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  33.72 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.72 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.15 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.04 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.29 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  30.94 
 
 		 198 aa  97.8  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  32.57 
 
 		 432 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.22 
 
 		 233 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.53 
 
 		 482 aa  94.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.53 
 
 		 482 aa  94.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.53 
 
 		 482 aa  94.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.53 
 
 		 482 aa  94.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  29.44 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.45 
 
 		 476 aa  92.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.65 
 
 		 442 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5199  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.67 
 
 		 471 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.71 
 
 		 521 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.65 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3019  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.14 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4604  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.29 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.34 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  30 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  30 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3173  hypothetical protein  34.9 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  34 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  28.96 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5922  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.34 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4150  hypothetical protein  28.66 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5956  hypothetical protein  29.46 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0211287  normal  0.0139937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  32 
 
 		 280 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0603  hypothetical protein  32.08 
 
 		 85 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0803  hypothetical protein  43.14 
 
 		 61 aa  47.8  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1536  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.35 
 
 		 512 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4772  hypothetical protein  28.57 
 
 		 645 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021908 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1254  hypothetical protein  26.26 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00805  hypothetical protein  20.95 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4574  hypothetical protein  30.69 
 
 		 417 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.284031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>