67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1895 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  46.24 
 
 
181 aa  137  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  41.11 
 
 
390 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.5 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  45.66 
 
 
181 aa  130  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  40.74 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  37.82 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  37.82 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.88 
 
 
192 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.17 
 
 
467 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.51 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  41.03 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  35 
 
 
196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.57 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  38.38 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.51 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  42.36 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  38.67 
 
 
200 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.67 
 
 
200 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  37.88 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.88 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.66 
 
 
233 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.87 
 
 
189 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  33.14 
 
 
188 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  34.17 
 
 
432 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.9 
 
 
561 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.87 
 
 
383 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  32.94 
 
 
189 aa  101  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.8 
 
 
236 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.8 
 
 
236 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.76 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4604  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.65 
 
 
220 aa  98.2  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.79 
 
 
464 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  35.47 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4882  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.14 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.46 
 
 
482 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.46 
 
 
482 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.46 
 
 
482 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.46 
 
 
482 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  33.53 
 
 
224 aa  91.3  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  33.53 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  33.53 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  33.53 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  33.53 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  33.53 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.96 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  29.63 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.97 
 
 
198 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.17 
 
 
472 aa  88.2  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.69 
 
 
522 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.44 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.85 
 
 
476 aa  81.3  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5199  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.77 
 
 
471 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3019  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.5 
 
 
230 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.45 
 
 
521 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3173  hypothetical protein  30.17 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  31.64 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1254  hypothetical protein  24.31 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5922  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.33 
 
 
114 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1536  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  24.26 
 
 
512 aa  51.6  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5295  hypothetical protein  46.27 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  42.86 
 
 
280 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4772  hypothetical protein  29.79 
 
 
645 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021908 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0566  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  24.32 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2506  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  24.3 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4150  hypothetical protein  35.44 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0803  hypothetical protein  42.86 
 
 
61 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>