67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1826 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  100 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  58.29 
 
 		 482 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  58.29 
 
 		 482 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  58.29 
 
 		 482 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  58.29 
 
 		 482 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  54.98 
 
 		 472 aa  215  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  46.81 
 
 		 467 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.96 
 
 		 390 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.04 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.04 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  42.96 
 
 		 561 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.25 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  36.27 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.36 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.64 
 
 		 181 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  46.56 
 
 		 442 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  38.66 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5199  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  46.56 
 
 		 471 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  35 
 
 		 196 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  42.18 
 
 		 476 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  34.55 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.06 
 
 		 198 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  43.15 
 
 		 205 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  40.71 
 
 		 522 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  32.89 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  34.54 
 
 		 432 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.62 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  33.03 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  33.03 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  33.03 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  33.03 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  33.03 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  41.84 
 
 		 521 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  35.18 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  42.86 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  31.22 
 
 		 188 aa  95.5  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  34.39 
 
 		 200 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.39 
 
 		 200 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.28 
 
 		 464 aa  92  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  30.22 
 
 		 189 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.64 
 
 		 383 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.86 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  31.96 
 
 		 200 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  31.96 
 
 		 200 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4882  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.13 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  31.75 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.62 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3173  hypothetical protein  33.53 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.28 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4604  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.5 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  35.95 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.96 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.63 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3019  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  21.05 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4150  hypothetical protein  42.19 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  42.25 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  26.6 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5295  hypothetical protein  42.59 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0566  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.27 
 
 		 130 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1254  hypothetical protein  27.5 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2506  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.27 
 
 		 130 aa  45.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5922  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.74 
 
 		 114 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1853  hypothetical protein  26.61 
 
 		 169 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1422  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  24.73 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4772  hypothetical protein  28.57 
 
 		 645 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>